《科学》封面：人类肿瘤里发现大量细菌 细胞内！

邓文龙

《科学》封面：人类肿瘤里发现大量细菌

来源：学术经纬 2020-05-29 12:36

今日，顶尖学术期刊《科学》杂志发表了一篇关于癌症研究的最新论文。以色列魏茨曼科学研究所（Weizmann Institute of Science）领衔的一支科研团队发现，在人类的肿瘤里，存在许多细菌。更令人感到神奇的是，这些细菌看似具有肿瘤特异性——不同的肿瘤样本，细菌的种类也有区分。这项工作对于理解肿瘤的微生物组有着重要意义，它也登上了本期《科学》杂志的封面。

研究人员们在论文中指出，早在100多年前，科学家们就在人类的肿瘤里检测出了细菌。一些人认为，这表明细菌在肿瘤的微环境里可能具有局部的作用；另一些人则指出，这些细菌的含量都非常低，很难确认它们真的来自肿瘤样本，还是来自外部的污染。

在这项研究里，科学家们做了迄今最为严格、也最为全面的分析，想要真正理解人类肿瘤样本里，细菌所扮演的角色。为了减少外部污染带来的潜在问题，他们综合使用了多种不同的方法，不但使用了16S rRNA的基因测序技术来寻找细菌，还辅以显微镜观察和细胞培养，来确认居住在肿瘤里的不同细菌。

研究人员们分析了乳腺癌、肺癌、黑色素瘤、胰腺癌等常见的7种实体肿瘤，样本数超过了1500份。分析结果确认，大部分的样本里都含有细菌。令人惊讶的是，这些肿瘤内找到的细菌，大多数都位于细胞内！无论是癌细胞，还是免疫细胞，研究人员们都在它们的身体里找到了细菌。

对于不同的肿瘤类型，细菌的种类也有所不同。研究人员们指出，不同的肿瘤有着不同的微生物组构成。相比之下，乳腺癌肿瘤的微生物组更为多样和丰富。此外，研究人员们也在论文里提到，这些细菌还和患者的吸烟史，以及对免疫疗法的反应有相关性。

《科学》杂志为这篇论文单独做了专文解读。解读里提出了几个关键的问题，其中一个问题便是：为啥会在肿瘤里发现细菌？

对于这个问题，科学家们做了几种假设。第一种假设认为，人体组织可能不像我们想象中那么“无菌”，而是一直存在少量的细菌。检测出某些能产毒素的细菌，可能预示着细胞处于一种炎症状态，这可能促进癌变。而当肿瘤真的出现后，一方面会对周围组织进行破坏，另一方面又会抑制免疫力，反过来促进细菌在体内乱窜，跑到原本应该无菌的位置。

当然，考虑到许多细菌都存在于细胞内，另一种可能性认为，这些细菌没法“自由”流窜到肿瘤和周边组织，而是被其他免疫细胞和/或癌细胞“搬运”过来的。

在这篇解读中，作者们也指出，即便这些细菌和肿瘤的发生有着关联，目前我们也很难去有效针对这些细菌。通常情况下，我们会通过饮食、药物、或者其他微生物，去对细菌进行干预。但我们还不了解是否能用同样的方法去对付住在肿瘤里的细菌。它们可能完全依赖细胞来获取营养，一般的抗生素也很难进入细胞杀死它们。

即便目前没有好的杀菌方法，这项研究依旧极其重要。更好地理解肿瘤微环境，就能更好地理解癌症发生和进展的机理。这有望带来全新的精准治疗和诊断方法。(生物谷Bioon.com）

http://news.bioon.com/article/6756418.html



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顾汉现

科学网 > 小柯机器人

科学家分析人类肿瘤微生物组组成

作者：小柯机器人 发布时间：2020/5/30 12:36:29

本期文章：《科学》：Volume 368 Issue 6494

以色列魏茨曼科学研究所Keren Levanon研究团队在研究中取得进展。他们发现人类肿瘤微生物组由特定肿瘤类型的细胞内细菌组成。该研究于2020年5月29日发表于《科学》。

他们对肿瘤微生物组进行了全面分析，研究了7种癌症类型（包括乳腺癌、肺癌、卵巢癌、胰腺癌、黑素瘤癌、骨癌和脑癌）中的1526种肿瘤及其邻近的正常组织。

他们发现每种类型的肿瘤都有独特的微生物组组成，乳腺癌具有特别丰富多样的微生物组。肿瘤内细菌大部分在细胞内，并且存在于癌细胞和免疫细胞中。他们还注意到肿瘤内细菌或其预测功能与肿瘤类型和亚型，患者的吸烟状况以及对免疫疗法的反应之间的相关性。

据悉，细菌是在100多年前在人类肿瘤中首次发现的，但由于其生物量低，肿瘤微生物组的表征仍然具有挑战性。

附：英文原文

Title: The human tumor microbiome is composed of tumor type–specific intracellular bacteria

Author: Deborah Nejman, Ilana Livyatan, Garold Fuks, Nancy Gavert, Yaara Zwang, Leore T. Geller, Aviva Rotter-Maskowitz, Roi Weiser, Giuseppe Mallel, Elinor Gigi, Arnon Meltser, Gavin M. Douglas, Iris Kamer, Vancheswaran Gopalakrishnan, Tali Dadosh, Smadar Levin-Zaidman, Sofia Avnet, Tehila Atlan, Zachary A. Cooper, Reetakshi Arora, Alexandria P. Cogdill, Md Abdul Wadud Khan, Gabriel Ologun, Yuval Bussi, Adina Weinberger, Maya Lotan-Pompan, Ofra Golani, Gili Perry, Merav Rokah, Keren Bahar-Shany, Elisa A. Rozeman, Christian U. Blank, Anat Ronai, Ron Shaoul, Amnon Amit, Tatiana Dorfman, Ran Kremer, Zvi R. Cohen, Sagi Harnof, Tali Siegal, Einav Yehuda-Shnaidman, Einav Nili Gal-Yam, Hagit Shapira, Nicola Baldini, Morgan G. I. Langille, Alon Ben-Nun, Bella Kaufman, Aviram Nissan, Talia Golan, Maya Dadiani, Keren Levanon

Issue&Volume: 2020/05/29

Abstract: Bacteria were first detected in human tumors more than 100 years ago, but the characterization of the tumor microbiome has remained challenging because of its low biomass. We undertook a comprehensive analysis of the tumor microbiome, studying 1526 tumors and their adjacent normal tissues across seven cancer types, including breast, lung, ovary, pancreas, melanoma, bone, and brain tumors. We found that each tumor type has a distinct microbiome composition and that breast cancer has a particularly rich and diverse microbiome. The intratumor bacteria are mostly intracellular and are present in both cancer and immune cells. We also noted correlations between intratumor bacteria or their predicted functions with tumor types and subtypes, patients’ smoking status, and the response to immunotherapy.

DOI: 10.1126/science.aay9189

Source: https://science.sciencemag.org/content/368/6494/973

期刊信息
Science：《科学》，创刊于1880年。隶属于美国科学促进会，最新IF：41.037
官方网址：https://www.sciencemag.org/
投稿链接：https://cts.sciencemag.org/scc/#/login

https://www.science.org/doi/10.1126/science.aay9189

https://news.sciencenet.cn/htmlp ... 12362946356756.shtm



重磅研究 | Nature：黑色素瘤中细菌源性HLA结合肽的鉴定

https://blog.sciencenet.cn/blog-3474220-1283899.html



https://weibo.com/u/1254333593?is_all=1

https://weibo.com/1254333593/L9W ... e#_rnd1641716906537