Science：利用eDNA工具发现稀有的海洋生物 胞屑泌

邓文龙

Science：利用eDNA工具发现稀有的海洋生物

eDNA能够从含有来自海洋生物的脱落的皮肤细胞、鳞屑、分泌物和其他物质的海水中获得  胞屑泌

2018-06-16 05:44

2018年6月16日/生物谷BIOON/---通过寻找世界各地的海洋来发现和研究珍稀濒危的海洋动物的日子还没有结束。然而，一种新出现的用于分析海水样本的工具可能有助于科学家比以往更多地了解稀有的海洋生物。根据美国石溪大学海洋与大气科学学院（SoMAS）的Ellen Pikitch博士的说法，这种面向21世纪的工具就是环境DNA（environmental DNA, eDNA）分析。她在2018年6月15日的Science期刊上发表一篇观点类型的论文，论文标题为“A tool for finding rare marine species”。

图片来自C. Emmons, NOAA Fisheries。

在海洋中，eDNA能够从含有来自海洋生物的脱落的皮肤细胞、鳞屑、分泌物和其他物质的海水中获得。经证实，该方法能够可靠地和无创性地检测稀有的、难以捉摸和难以研究的物种，如受威胁的鲸鱼、鲨鱼和海豚。

在这篇论文中，Pikitch解释了eDNA如何用于检测物种的存在并定量确定物种的丰度。她将这种方法与其他用于研究稀有海洋物种的技术进行了比较，其中许多技术不太灵敏，需要高强度的劳动，而且涉及捕获动物和破坏栖息地。

Pikitch说，“eDNA在很多方面都优于传统的研究海洋物种的方法。鉴于其优势，eDNA可能很快成为检测稀有的和难以捉摸的海洋物种的首选方法。”

此外，eDNA方法正在快速地得到改进并变得更具成本效益。

她总结道，“作为主流方法的补充和基于其自身的优点，eDNA有望加速我们对海洋生物的理解。”（生物谷 Bioon.com）

参考资料：

Ellen K. Pikitch. A tool for finding rare marine species. Science, 15 Jun 2018, 360(6394):1180-1182, doi:10.1126/science.aao3787

http://science.sciencemag.org/content/360/6394/1180

http://news.bioon.com/article/6723540.html



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邓文龙

环境DNA(eDNA)技术在水生生态系统中的应用研究进展

单秀娟,李 苗,王伟继
1.农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 山东省渔业资源与生态环境重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071;2.青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 青岛 266071;3.上海海洋大学海洋科学学院 上海 201306
摘要:
环境DNA(Environmental DNA, eDNA)是指从皮肤、黏液、唾液、精子、分泌物、卵、粪便、尿液、血液、根、叶、果实、花粉和腐烂体等释放出来的、普遍存在的、游离的DNA分子。环境DNA技术是指从环境样品(土壤、沉积物和水体等)中直接提取DNA片段后利用测序技术进行定性或定量分析的方法。近年来随着分子生物学的发展，环境DNA技术已经成为一种新的水生生物调查方法，其主要被用来进行生物入侵的防治、濒危物种的保护、生物多样性的评价以及生物量的评估等。作者综述了环境DNA技术的发展历程、操作流程、在水生生态系统中的应用、优势以及存在的问题，同时对环境DNA在生态学领域中的应用前景进行了展望。

http://journal.yykxjz.cn/yykxjz/ ... 71025001&flag=1



环境DNA及其在水生生态系统保护中的应用

马鸿娟1*,STEWART Kathryn1,马利民1,任文伟1,2,赵建夫1
(1同济大学环境科学与工程学院， 上海 200092； 2世界自然基金会（WWF)北京代表处， 上海 200083）

摘要
环境DNA（environmental DNA, eDNA）是指可以从环境样品（如水、土壤、空气、冰芯等）中直接提取到的DNA片段总和。eDNA技术是在确定调查物种或种群的特异性基因识别片段的基础上，利用各种分子手段检测从环境介质中所提取eDNA包含识别片段的情况，进而确定取样环境中生物的分布状况，包括eDNA获取、eDNA分析和结果分析3个阶段，是近年来新出现的一种生物调查方法。与传统方法相比，eDNA技术具有灵敏度高、省时省力、对调查对象无损伤等优点，不要求调查者具有传统的生物识别及鉴定经验。目前eDNA技术已被应用于目标物种（如入侵物种、濒危物种及其他稀有物种）“有无”的检测、生物量的估测、水体生物多样性的调查等，在水生生态系统的保护中具有广泛的应用前景，但目前仅在少数发达国家展开应用，亟待进一步推广。目前研究者们所用的eDNA方法各不相同，有待对现有方法进行完善并建立技术标准；作为一种调查方法，其时间及空间精确度有待进一步评价；利用eDNA技术估测生物量的准确度还较低，建议首先提高对eDNA产生与降解动力学的认识，再进一步寻求提高其准确度的方法。

http://www.cje.net.cn/CN/abstract/abstract7877.shtml