《自然》:科学家测定向日葵基因组

邓文龙

作者：Nicolas Langlade

来源：《自然》

发布时间：2017/5/25 13:18:32

科学家测定向日葵基因组

  

《自然》近日发表的一篇论文报告了一个高质量的向日葵参考基因组。这一资源将为未来的研究提供借鉴，帮助人们在考虑到农业限制因素和人类营养需求的前提下，利用遗传多样性改善向日葵的抗逆性和产油量。

向日葵是一种全球性的油料作物。由于能在包括干旱在内的各种环境条件下保持稳定的产量，向日葵显示出了适应气候变化的特征。然而直到最近，研究者都难以完成向日葵基因组的组装，因为它主要是由高度相似的相关序列组成的。

法国卡斯塔内托洛桑国家农业研究院的Nicolas Langlade及同事测序了驯化向日葵的基因组，并进行了比较和全基因组分析，为一类开花植物——菊类植物的演化史带来了启示。他们还找到了新的候选基因，并重构了花期和油脂代谢这两大育种性状的遗传网络，并发现花期网络是由最近的全基因组倍增塑造的。

这意味着，在数千万年中，古老的横向同源基因（基因组中由于倍增产生的同源基因）都能在同一调控网络中保留下来。研究人员总结称，他们的研究强化了向日葵作为生物、演化和气候变化适应研究模型的地位，且有助于加快向日葵育种。（中文来源：科学网 张章）

http://paper.sciencenet.cn/htmlpaper/201752513183239743987.shtm

http://www.nature.com/nature/jou ... ll/nature22380.html



（華成旅行最便宜 03-3833-9823)

邓文龙

软件译：

自然| 信        开放

向日葵基因组提供了对油代谢，开花和Asterid进化的见解

HélèneBadouin，        JérômeGouzy，        克里斯托弗J. Grassa，        Florent Murat，        S.埃文·斯顿， Ludovic Cottret，        Christine Lelandais-Brière，        格雷戈里·欧文斯，        塞瓦斯蒂·卡雷，        Baptiste Mayjonade，        Ludovic Legrand，        Navdeep Gill，        诺兰C.凯恩，        约翰·E·鲍尔斯，        Sariel Hubner， Arnaud Bellec，        AurélieBérard，        HélèneBergès，        尼古拉斯Blanchet，        玛丽-克劳德·博尼，        多米尼克·布鲁内尔，        Olivier Catrice，        Nadia Chaidir，        Clotilde Claudel，        CécileDonnadieu et al。
隶属关系捐款通讯作者
性质 （2017） DOI：10.1038 / nature22380
收到 2016年11月29日 公认 2017年4月16日 在线发布 2017年5月22日

驯化的向日葵，向日葵，是一种全球性的油料作物，具有应对气候变化适应的前景，因为它可以在多种环境条件下保持稳定的产量，包括干旱1。更大的弹性是通过性等位基因从兼容的野生向日葵亲戚矿业实现2，3，包括许多嗜极物种4。在这里，我们报告了向日葵基因组（3.6 gigabases）的高品质参考，以及来自营养和花器官的广泛转录组学数据。基因组主要由高度相似的相关序列5组成，并且需要用于成功组装的单分子实时测序技术。基因组分析能够重建Asterids的进化史，进一步确立了Asterids II进化枝6基因全基因组三倍体的存在，以及约2900万年前的向日葵特异性全基因组重复7。结合定量遗传学，表达和多样性数据的综合方法，允许开发两个主要育种性状，开花时间和油代谢的综合基因网络，并在这些网络中揭示了新的候选基因。我们发现开花时间的基因组结构已经由最近的全基因组重复形成，这表明古代的旁系同源物可以保持在几十万年的同一个监管网络中。这个基因组代表了未来的研究计划，旨在利用遗传多样性，提高生物和非生物胁迫抗性和石油生产的基石，同时还要考虑农业的制约和人的营养需求8，9。

详细：
http://www.nature.com/nature/jou ... ll/nature22380.html



（華成旅行最便宜 03-3833-9823)