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PNAS:癌症需要在癌变之前将其制服 TCGA和GWAS 免疫预防疫苗

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发表于 2016-9-21 09:39:57 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
TCGA和GWAS  免疫预防 HPV疫苗

博文

PNAS:癌症需要在癌变之前将其制服  精选

已有 1223 次阅读 2016-9-20 16:25

个人分类:饮食与健康|系统分类:海外观察|关键词:癌症,免疫疗法,疫苗,美国,中国

PNAS:癌症需要在癌变之前将其制服

诸平

据美国加州大学圣地亚哥分校(University of California San Diego)2016年9月16日提供的信息,美国波士顿大学医学院(Boston University School of Medicine)、华盛顿大学(University of Washington)、美国癌症研究所癌症研究中心(Center for Cancer Research, National Cancer Institute)、美国德州大学安德森癌症研究中心(The University ofTexas MD Anderson Cancer Center)、哈佛陈曾熙公共卫生学院(Harvard T. H. Chan School of Public Health)、美国加州大学圣地亚哥分校(University of California San Diego)、强生药业公司(Pharmaceutical Companies of Johnson & Johnson)、丹娜-法伯癌症研究所(Dana–Farber Cancer Institute)、拉荷亚变态反应和免疫学研究所(La Jolla Institute for Allergy and Immunology)以及约翰·霍普金斯大学医学院(The Johns Hopkins University School of Medicine)的研究人员合作,前不久(9月14日)在《美国国家科学院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences,PNAS)发表论文,明确指出对于癌症的预防,也就是在其尚未形成之前的治疗和预防极为重要,我们更应该像美国副总统乔·拜登(Vice President Joe Biden)牵头的美国联邦癌症月球探测器规划(thefederal Cancer Moonshot program)一样,集中精力研究调动自身免疫系统来预防癌症的发生。相关研究结果详见:Avrum Spira, Mary L. Disis, John T. Schiller, Eduardo Vilar, Timothy R. Rebbeck, Rafael Bejar, Trey Ideker, Janine Arts, Matthew B. Yurgelun, Jill P. Mesirov, Anjana Rao, Judy Garber, Elizabeth M. Jaffee, Scott M. Lippman. Leveraging premalignant biology for immune-based cancer prevention(点击可以免费下载). Proceedings of the National Academy of Sciences, September 14, 2016,  http://www.pnas.org/content/early/2016/09/14/1608077113.abstract
http://www.pnas.org/content/early/2016/09/14/1608077113.full.pdf

加州大学圣地亚哥分校(Universityof California - San Diego)等多家单位的研究人员合作在PNAS杂志上发表的论文明确指出,对于癌症的预防,也就是在其尚未形成之前的治疗和预防更为重要,人们更应该注意免疫预防。美国加州大学圣地亚哥分校穆尔斯癌症中心主任、同时也是论文的共同主要作者斯科特·M.利普曼(Scott M.Lippman)说:“近年来,已经投入了大量的精力和资源来研究癌症的治疗问题,已经取得了重大研究进展,使20多年以来,癌症死亡率出现稳步下降趋势(见图1,Rebecca L.Siege, Kimberly D. Miller, Ahmedin Jemal. Cancer Statistics 2016. CA Cancer JClin, 2016, 66: 7-30.),但是,在美国仍然每年有超过100万人死于癌症,有数百万人遭受癌症的折磨。如果我们要根除这一灾难,我们必须共同努力来阻止癌症的发生。”


FIGURE 1. Trends in Cancer Incidence andDeath Rates by Sex, United States, 1975 to 2012.

这些来自不同单位的PNAS论文的作者团队,其专长包括了免疫学、基因组学、表观基因组学、计算生物学,疫苗和医学遗传学等领域。他们指出新研究工具和其他发展,现在可以详细解读不同的癌症究竟是如何开始的,良性组织或尚未形成癌症的组织究竟是如何转变为恶性和致命的癌症。

另一位主要作者,约翰·霍普金斯大学医学院(Johns Hopkins University School of Medicine)Sidney Kimmel综合癌症研究中心(The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center)副主任,医学博士伊丽莎白·M.贾菲(Elizabeth M. Jaffee, MD)说: “致癌性转换需要是一系列的步骤,身体的免疫系统能够在恶变之前进行拦截,即预防癌症的发生,它在我们所有人的体内每天都会发生无数次,这种自然抗癌能力正是我们所应该利用的。构建起我们先天防御癌症的体系就是新免疫疗法的基础,在不久的将来新免疫疗法在癌症防治方面会显示大有希望之势。”


作者同时指出,癌症的防治并非易事,依然任重道远,还必须做更多的工作。如癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)和全基因组关联研究(genome-wide association studies, GWAS),就是在不同人体内寻找常见的遗传变异体,看任何变体是否与某种特征或与癌症有关。在这种情况下, TCGA和GWAS已经在肿瘤免疫和精准治疗的基础研究方面取得显著进展,它们会大幅度拓展对于癌症的预防效果。

关于癌症疫苗的继续深入研究和新发展依然至关重要,不可有丝毫怠慢。斯科特·M.利普曼说,值得注意的是由美国国家癌症研究所(NCI)代理所长道格拉斯·R.罗伊医学博士(NCI Acting Director Douglas R. Lowy, MD)和PNAS论文的合作者约翰•席勒博士(John Schiller, PhD)共同开发的人类乳头状瘤病毒(human papilloma virus,HPV)疫苗,已经证明对与几种类型癌症有关的菌株有抵抗作用,提供了接近100%保护作用。

2016年早些时候,人类疫苗项目(Human Vaccines Project)是一项学术研究中心、企业、非营利组织和政府机构共同参与的全球性公私合作项目,其目的就在于加速下一代疫苗和免疫疗法的研发工作,加州大学圣地亚哥分校(UC San Diego)和斯克里普斯研究所(The Scripps Research Institute)、J.克雷格·文特尔研究所(J. Craig Venter Institute)和拉荷亚过敏和免疫学研究所(La Jolla Institute for Allergy and Immunology)联合对外宣布将作为疫苗研究中心。

PNAS论文的作者引用了一些时机成熟、可以立即开展预防工作的癌症,其中包括林奇综合症(Lynch syndrome)。所谓林奇综合征是最常见的一种遗传性结直肠癌综合症,占结直肠癌的2%~5%。林奇综合症指的是那些具有错配修复基因(MMR)突变导致易患结直肠癌和其他恶性肿瘤的个体,包括那些已经患有肿瘤和尚未发生肿瘤的人。林奇综合症与许多癌症的风险增加有关,包括消化神经束和妇科神经束(digestive and gynecologic tracts);克隆造血作用(clonal hematopoiesis),因为这是一种与年龄有关白血病的前兆; 还有由人类乳头瘤病毒引起的宫颈组织异常生长,有可能会发展为宫颈癌。

造血过程始终伴随血细胞的体细胞性基因突变,平均每个造血干细胞每10年发生1.3±0.2个外显子突变,尽管其中大多数突变为无功能的过客基因突变,不增加造血细胞克隆的扩张潜能。但部分突变基因为驱动基因或血液系统肿瘤相关基因,其突变可导致造血干细胞获得增殖和自我更新优势,使突变基因携带者发生血液系统肿瘤的危险性增加,因此,发生于健康人群中的基因突变愈来愈受到重视。Jaiswal等人采用全基因组测序技术检测了17 182名血液学正常人群外周血细胞160种常见的血液肿瘤相关基因的改变,结果在746名正常人群中检测到73个基因(805个变异体)发生了突变,其中693人为单一基因突变,平均累及18%的外周血白细胞,即发生了克隆性造血。研究发现,基因突变发生率与年龄密切相关,40岁以下者发生率极低,而65~69岁者达到5.6%,90~108岁更是高达18.4%。

斯科特·M.利普曼说:“预防研究已经取得了长足进步,但进展一直是轶事和孤立的,如果我们的目标是消灭癌症,我们需要一种对于癌变前疾病治疗和癌症预防的全新聚焦、投资和方法,其中任何一种都需要得到广泛而持续的支持,就像癌症月球探测器和人类疫苗项目(Cancer Moonshot andHuman Vaccines Project)一样,需要下大功夫进行研究。”

更多信息请注意浏览原文

中国2014年癌症状况(来自 WHO:2014年癌症国家状况):

1 癌症死亡状况



2 年龄标准化癌症死亡趋势


3 癌症发病


转载本文请联系原作者获取授权,同时请注明本文来自诸平科学网博客。
链接地址:http://blog.sciencenet.cn/blog-212210-1004006.html
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 楼主| 发表于 2016-9-21 09:45:47 | 只看该作者
PNAS:
http://www.pnas.org/content/early/2016/09/14/1608077113

http://doc.sciencenet.cn/DocInfo.aspx?id=24409  :
文献正文
利用生物癌前基于免疫预防癌症
zhpd55添加于2016年9月18日16时25分32秒 95次阅读| 0次推荐| 0个评论
预防是根除癌症的一个基本组成部分。癌症基因组与表观基因的新一代测序已经定义了大量的司机突变和分子分组,导致治疗的进展。通过比较,有在癌前病变这样的知识,这固有地限制了开发精度预防策略的电位的相对贫乏。已研究种系和体细胞事件之间的相互鉴定恶变前进展和预防靶标的遗传过程。在免疫系统的拦截癌前病变及防癌能力的新兴数据暗示。遗传工程小鼠模型已确定由遗传驱动器和其它体细胞改变募集炎性细胞并诱导在正常细胞中的改变,以创建并与癌前肿瘤微环境相互作用,以促进肿瘤发生和免疫逃避机制。目前这些研究仅限于少数病变类型和患者。从这个角度看,我们提倡大规模的协作努力,系统地映射癌前病变的生物学和周围的细胞反应。通过从不同学科汇集的科学家(如生化,组学和计算生物学,微生物学,免疫学和医学遗传学;工程,成像和合成化学和落实科学),我们可以开车集中在癌症疫苗共同努力重新编程的免疫反应,以防止,检测和拒绝癌前病变。Lynch综合征,克隆造血,与宫颈上皮内瘤变也作为模型遗传综合征,血液和病毒premalignancies,都在推出这一举措的理想方案。
作者: Avrum斯培拉,玛丽L. Disis,约翰T.席勒,爱德华多·维拉尔,蒂莫西·R·里贝克,拉斐尔·贝哈尔,三分球Ideker,珍妮艺术,马修B. Yurgelun,吉尔P. Mesirov,安佳娜饶,朱迪·加伯,伊丽莎白M.贾菲,斯科特M.李普曼。期刊名称:国家科学学院院刊期卷页:批准2016年8月15日第卷第期1-9页学科领域:医学科学»肿瘤学»预防肿瘤添加人是否为作者:否原文链接:http://www.pnas.org/content/early/2016/09/14/1608077113 DOI: 10.1073 / pnas.1608077113 ISBN:关键词:癌前病变,生物学,疫苗,预防癌症,免疫肿瘤全文地址:下载备注:上更加强调免疫为主上周在PNAS发表透视片,癌症研究人员来自全国各地,包括医学和穆尔斯癌症中心的加州大学圣迭戈大学法学院教师,编写预防应成为像联邦癌症登月计划,由副总统拜登领导的新的努力。

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 楼主| 发表于 2016-9-21 09:54:19 | 只看该作者
PNAS:如何攻克癌症?在变成癌症之前阻止它

来源:生物谷 2016-09-18 19:29

2016年9月18日讯 /生物谷BIOON/ --在本周发表在国际学术期刊PNAS上的一篇观点文章中,来自加州大学圣地亚哥分校医学院和莫里斯癌症中心等机构的癌症研究人员,在文中表示基于机体免疫开发的癌症预防措施应当得到更多关注,拜登副总统等人提出的癌症登月计划以及其他针对攻克癌症作出的努力应当把癌症预防放在重要位置。

“科学领域已经在癌症治疗方面投入了巨大精力和资源,最近几年取得了显著进展。在过去的二十多年里癌症死亡率稳步下降,”莫里斯癌症中心所长Scott M. Lippman这样说道,他也是这篇文章的共同作者。“但是每年仍有超过一百万美国人死于癌症,也有更多人遭受癌症带来的痛苦。如果我们想要彻底根除这一祸害,必须共同合作阻止癌症发生。”

参与文章编写的作者们来自多个不同的研究机构,覆盖了免疫、基因组学、表观遗传组学、计算生物学、疫苗以及医学遗传学等领域,作者们表示新研究工具的出现以及其他方面的进步让科学家们得以破解不同癌症发生的细节,了解良性和癌变前组织如何变得恶性和致命。

“细胞的恶性转化包含了一系列步骤,”来自约翰斯霍普金斯大学医学院的Elizabeth M. Jaffee这样说道。“机体的免疫系统能够在细胞发生恶性转化之前及时发现并阻止癌症的发生。事实上每个人体内的免疫系统每天都会进行无数次这样的活动。这种天然防御能力是我们想要利用的东西。对抗癌症的天然防御机制是新型免疫治疗方法的基础,目前已经显现出巨大希望。”

但是作者们表示要做的还有很多。类似癌症基因组图谱计划(TCGA)以及全基因组关联分析(GWAS)这样的努力能够大大推动肿瘤免疫学和精准医学的进步,在不同的人群中寻找常见的基因变异,观察基因变异是否与任何一种性状有关,这里所指的就是癌症。肿瘤免疫学和精准医学应该得到进一步扩展,用于癌症预防,文章作者们写道。

癌症疫苗研究的继续和新发展将会变得非常重要,Lippman表示,他指出人类乳头瘤病毒疫苗能够为接种者提供近乎百分之百的保护,帮助对抗与几种癌症有关的病毒种类。

今年早些时候,人类疫苗计划宣称加州大学圣地亚哥分校、斯克利普斯研究所、J. Craig Venter研究所和La Jolla过敏和免疫学研究所将作为疫苗研究的中心。该计划是一个全球合作项目,得到了学术研究中心、企业、非营利机构和政府机构的支持和参与,该计划旨在加速下一代疫苗和免疫治疗的开发。

作者们还在文中列举了一些研究得比较成熟可以立即进行预防的情况,其中包括可能增加多种癌症风险的林奇综合症,可能发展为白血病的克隆造血,可能发展为宫颈癌的宫颈上皮内瘤样病变。

“预防性研究取得很大进步,但是研究仍然较少也比较孤立,”Lippman这样说道。“如果我们想要根除癌症,就需要在癌变前疾病和癌症预防领域得到更多关注和投资,找到新的方法。应该得到癌症登月计划和人类疫苗计划这种广泛深度努力的支撑和维持。”(生物谷Bioon.com)

DOI: 10.1073/pnas.1608077113

Leveraging premalignant biology for immune-based cancer prevention

Avrum Spira, Mary L. Disis, John T. Schiller, Eduardo Vilar, Timothy R. Rebbeck, Rafael Bejar, Trey Ideker, Janine Arts, Matthew B. Yurgelun, Jill P. Mesirov, Anjana Rao, Judy Garber, Elizabeth M. Jaffee, and Scott M. Lippman

http://www.pnas.org/content/early/2016/09/14/1608077113

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