科学:拟南芥三萜化合物对植物根系微生物组的调控规律

邓文龙

研究揭示拟南芥三萜化合物对植物根系微生物组的调控规律

与不能合成三萜的水稻和小麦相比，52%拟南芥特异的根系微生物组被三萜合成基因显着调控

来源：遗传与发育生物学研究所 2019-06-14 12:44

植物不可移动，但在自然土壤中进化出了强大的适应能力，在根系招募大量且种属特异、种类繁多的微生物（根系微生物组）。这些微生物参与植物吸收营养、抵抗疾病和非生物胁迫等重要生理过程。植物调控根系微生物组的机制对植物生长和健康非常重要，也是根系微生物组领域的研究热点。植物将20 ~ 30%光合作用产物在根系合成化合物，是为了防御病原菌或资源浪费吗？这些化合物是否参与植物与根系微生物的互作过程，是否直接调控特异种类的根系微生物？这些问题一直没有明确的答案。

中国科学院遗传与发育生物学研究所、中国科学院-英国约翰英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心(CEPAMS)白洋研究组与John Innes Centre的Anne Osbourn研究组合作在《科学》（Science）上发表文章，揭示了拟南芥三萜类化合物对根系微生物组的调控规律。该工作系统地解析了拟南芥中形成基因簇的三萜合成遗传网络。该网络的关键基因在植物根系特异表达，并具有潜力合成50多种未知的根系化合物（目前能稳定检测到的根系化合物大约300种）。与不能合成三萜的水稻和小麦相比，52%拟南芥特异的根系微生物组被三萜合成基因显着调控。通过分离培养的细菌资源库与纯化/合成的单种或混合化合物共培养，发现三萜化合物直接调控特异的根系细菌种类。同时根系细菌可以特异性修饰和利用拟南芥三萜化合物。该研究为利用植物天然化合物促进根系益生菌在绿色农业中的应用提供了理论依据。

上述结果于5月10在线发表于Science杂志(DOI：10.1126/science.aau6389)。Anne Osbourn组博士后黄安诚和白洋组博士研究生姜婷为共同第一作者，白洋和Anne Osbourn为共同通讯作者。白洋组工程师刘永鑫、助理研究员曲宝原参与了该项目。该研究得到中科院战略性先导科技专项、前沿科学重点研究项目、国家自然科学基金委国际合作研究与交流项目和中科院微生物组项目支持。(生物谷Bioon.com）

http://news.bioon.com/article/6739800.html



模式生物  拟南芥

在实验室作为模式生物种植的拟南芥
植物学家和生物学家在1900年代初期开始研究拟南芥，1945年前后首次对突变体进行了系统描述[7]。拟南芥现在已经被广泛的用于研究植物科学，包括遗传学，进化，种群遗传学，和植物发育研究中[8][9][10]。尽管拟南芥在农业上并无多少直接的贡献，但有几个优点使其成为研究有花植物的遗传、细胞、分子生物学的一个有用的模式生物。其在农业科学中所扮演的角色正仿佛小鼠和果蝇在人类生物学中的一样。
拟南芥基因组之小有利于基因定位和测序。其基因组大约为12,500万碱基对和5对染色体，在植物中算是小的。在2000年，拟南芥成为第一个基因组被完整测序的植物。[11]在探明至今已发现的25,500个基因的功能上已作出了非常多的工作。[12]
植株之小与生活周期之短同样也是拟南芥的优点。实验室常用的许多品系，从萌芽到种子成熟，大约为六个星期。植株之小方便其在有限的空间内培养，而单个植株能产生几千个种子。此外，其自花传粉的机制也有助于遗传实验。 所有这些都使拟南芥成为遗传研究的模式生物。
最后，利用根瘤农杆菌把DNA转化进拟南芥基因组已是常规操作。而现在利用“花序浸渍法”（floral-dip）进行转化并不涉及组织培养和植株再生。

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