在一项新的研究中，来自中国科学院和上海交通大学的研究人员发现大多数被研究的circRNA倾向于在分子内形成长16～26bp的不完美的RNA双链体（dsRNA）。此外，circRNA优先结合dsRNA激活的蛋白激酶（PKR），并且起着PKR抑制剂的作用。相关研究结果发表在2019年5月2日的Cell期刊上，论文标题为“Structure and Degradation of Circular RNAs Regulate PKR Activation in Innate Immunity”。论文通讯作者为中国科学院生物化学与细胞生物学研究所的陈玲玲（Ling-Ling Chen）研究员、中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所的杨力（Li Yang）研究员和上海交通大学医学院附属仁济医院的沈南（Nan Shen）研究员。
PKR由dsRNA直接激活，并在对dsRNA的细胞质反应中起重要作用。为了了解circRNA如何与PKR结合并调节它的激活，这些研究人员对通过引物延伸与突变分析测试方法分析的选择性2'-羟基酰化反应（selective 2'-hydroxyl acylation analyzed by primer extension and mutational profiling, SHAPE-MaP）进行了优化，发现大多数被研究的circRNA倾向于形成长16～26 bp的不完美的RNA双链体，所形成的RNA双链体在细胞中作为PKR抑制剂发挥作用。这表明RNase L对circRNA的大量和快速降解是PKR在先天免疫反应早期阶段的激活所必需的。
