2018年8月12日/生物谷BIOON/---细胞系是癌症研究的支柱。这些细胞群体,通常是从患者的肿瘤样本中收集并在实验室中进行培养的,可在体外无限制地生长,从而能够用于从基础遗传研究到药物发现的一切应用中。不过,虽然科学家们认为即便单个细胞系持续地生长和分裂,它们仍然保持遗传上的一致性,但是在一项新的研究中,来自美国布罗德研究员、达纳-法伯癌症研究所、哈佛医学院、麻省总医院、布莱根妇女医院和霍华德-休斯医学研究所的研究人员发现它们实际上能够以大幅改变它们对药物作出反应的方式进行进化。细胞系中的细胞株持续进化---可能是由它们生长的实验室条件触发的---可能有助于解释为何使用相同细胞系的不同研究通常会产生相互矛盾的结果。相关研究结果于2018年8月8日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Genetic and transcriptional evolution alters cancer cell line drug response”。论文通信作者为布罗德研究员核心创始成员Todd Golub和达纳-法伯癌症研究所成人神经癌症学家Rameen Beroukhim。
当重新分析来自两个大的集合---布罗德-诺华癌细胞系百科全书(Broad-Novartis Cancer Cell Line Encyclopedia, CCLE)和桑格研究所癌症药物基因组学(Sanger Institute's Genomics of Drug Sensitivity in Cancer)---中保存的106个细胞系时,他们首先开始猜测这些细胞系发生进化,不过他们发现存在高水平的变异。比如,他们发现19%的基因突变仅存在于其中的一个集合中。
Uri Ben-David, Benjamin Siranosian, Gavin Ha et al. Genetic and transcriptional evolution alters cancer cell line drug response. Nature, Published Online: 08 August 2018, doi:10.1038/s41586-018-0409-3.